本校為鼓勵各學院有效整合教學資源、開設跨院或跨領域、產學合作及創新實驗性課程,提升本校教師創新教學能量,增進學生學習成效,於104年2月26日訂定「國立臺東大學創新教學辦公室設置及補助申請作業要點」。理工學院創新教學辦公室依據其要點於104年3月份設置「創新教學辦公室」,並置行政助理一名,執行工作包含協助開設課程、計畫執行、辦理競賽、講座及其他有關教學等事項。
執行成效